A JUE é uma solução completa de facilitação de comércio que inclui todas as infra-estruturas e recursos necessários para o estabelecimento duma operação eficiente, eficaz e sustentável e com crescimento contínuo para o desembaraço aduaneiro de mercadoria e sua monitorização.

O Sistema da JUE é constituído por dois subsistemas informáticos distintos, que dialogam entre si, nomeadamente, o CMS - Customs Management System (sistema de gestão aduaneira) para processos aduaneiros e de uso exclusivo das Alfândegas e o Tradenet uma plataforma informática destinada a permitir a interligação e troca de informação com todos os utentes do processo aduaneiro, tais como os despachantes aduaneiros, empresas de navegação, operadores portuários, terminais de mercadorias, bancos comerciais, entre outras entidades envolvidas nos processos de desembaraço aduaneiro.